尽管黄锈石具有许多特点，但在使用过程中也可能出现一些问题。

　　由于其质地较为柔软且含水量高，黄锈石容易受到外力的影响而产生裂痕、断裂等损坏。

　　在使用黄锈石时需要注意避免使用过硬的工具进行加工，也要避免石材与坚硬物体摩擦或碰撞。

　　黄锈石的颜色在不同光照和空气潮湿度下可能会有所变化，出现色差。

　　黄锈石表面光滑，容易造成滑倒摔伤的危险，特别是在步道、楼梯等场所使用时需要特别注意防滑措施。黄锈石的石孔较多，容易聚灰尘、污渍等杂质，需要经常进行清洁和保养。